检察院批捕意味着还是要追究交通肇事罪的刑事责任的。双方调解只是民事赔偿部分，民事赔偿的刑事部分可以从轻、减轻处罚。检察院批捕后，等公安机关侦查结束将案件移送检察院审查起诉，由检察院提起公诉，由法院对交通肇事罪判决。
通过双方调解处理的，对于受害者而言，可以较快地得到赔偿，时间较短，但也有可能会因此放弃部分的赔偿，不能得到全额赔偿。而且如果对方到时不按调解协议履行的，仍然要通过法院诉讼来解决。
如果是通过法院诉讼的，可以得到应有的赔偿，但一是可能时间会稍长，而且还要承担相应的举证义务，相对来说要求比较严格，要做的工作也会比较多，也会花费比较多的时间和精力。
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